Ancienne commune du canton de Saint-Gall, région du Toggenbourg, ayant fusionné en 2009 avec Mogelsberg et Sankt Peterzell pour former la commune de Neckertal. Le village de Brunnadern et les hameaux de Chrüzweg, Spreitenbach, Furt (partiellement sur le territoire de Mogelsberg) et Taa sont situés au fond de la vallée du Necker, au pied nord du col de Wasserfluh. Le reste du territoire, très diversifié et collineux, comprend les hameaux de Bitzi, Waldschwil, Vögelisegg, Steig, Haselacker, Schwendi, Niderwil, Reitenberg, Homberg et Hinteregg. 1377 Brunadran. 930 habitants en 1803, 781 en 1827, 931 en 1850, 710 en 1900, 735 en 1950, 587 en 1970, 917 en 2000, 839 en 2008.
Cette région, tardivement habitée, dépourvue de centre villageois jusqu'au XVIIIe siècle, dépendait à la fin du Moyen Age des comtes de Toggenbourg et passa en 1468, avec le Toggenbourg, à l'abbaye de Saint-Gall. Une partie était soumise à la juridiction de Hemberg, l'autre à celle de la vallée du Necker. Une chapelle médiévale fut remplacée en 1461 par un nouvel édifice, filiale de la paroisse d'Oberhelfenschwil. En 1528, les habitants adoptèrent la Réforme. La paroisse (Kirchgemeinde) ne fut créée qu'en 1708; l'église fut construite en 1763 par Hans Ulrich Grubenmann. En 1803, les différents hameaux et parties du village s'unirent pour former la commune de Brunnadern.
De nombreuses fermes typiques du Toggenbourg, datant des XVIIe et XVIIIe siècles, subsistent dans le village même, ainsi qu'à Spreitenbach et à Furt. Une école itinérante est signalée en 1745. En 1874, Brunnadern et Reitenberg formèrent un arrondissement scolaire. Après l'expansion de la filature et du tissage à domicile aux XVIIe et XVIIIe siècles (travail à domicile), de plus grandes entreprises textiles furent ouvertes au XIXe siècle: une filature et une teinturerie à Brunnadern, des usines de tissage à Brunnadern, Furt et Spreitenbach (industrie textile). En 1872 enfin, une fabrique de nouilles fut installée (industrie alimentaire). La broderie industrielle, qui se développa dès 1850, connut son apogée vers 1880 puis s'effondra lors de la crise des années 1920. Petites exploitations agricoles familiales, artisanat, petite industrie et tourisme caractérisent Brunnadern depuis 1945. Une station du chemin de fer Toggenbourg-lac de Constance fut ouverte à Brunnadern en 1910, ainsi qu'en 1912 la station de départ de la ligne postale pour Sankt Peterzell et Waldstatt. Le groupement scolaire secondaire de Brunnadern-Oberhelfenschwil-Mogelsberg, fondé en 1956, inaugura en 1977 le centre secondaire supérieur du Necker. L'Eglise réformée ouvrit en 1971 un home médicalisé. La fin du XXe siècle a vu le nombre des exploitations agricoles régresser et les emplois augmenter dans les secteurs secondaire et tertiaire.