Comm. française, dép. du Haut-Rhin, faisant partie de l'agglomération bâloise, ayant compris Bourgfelden jusqu'en 1798. 1230 Hegenheim. 62 feux en 1720, 291 en 1788; 1322 hab. en 1789, 2151 en 1841, 2576 en 2004. H. fit partie du diocèse de Bâle; l'église Saint-Rémy est attestée depuis le XIVe s. (nouveau bâtiment de la fin du XVIIIe s.). Dès le XVe s., H. fut le fief des Bärenfels, dès 1692 celui des Barbier. De 1939 à 1945, tous les habitants furent évacués dans la région des Landes. Après 1960, la commune devint une cité dortoir comptant de nombreux navetteurs.
Depuis le XVIIe s., un grand nombre de juifs s'installèrent à H., venus notamment de Birseck et d'Allschwil en 1694. Ils étaient 14 familles en 1689, 83 familles soit 409 personnes en 1784, 725 habitants en 1851, 110 en 1905 et 20 en 1954. Le cimetière juif ouvert en 1673 est encore utilisé par des communautés israélites d'Alsace et de Suisse. Dès 1789, le Sundgau vécut plusieurs pogroms. La synagogue de 1740 fut détruite en 1815 et reconstruite en 1821. Lors du Judenrumpel, entre février et avril 1848, 850 juifs furent chassés temporairement. De 1805 jusqu'à 1866, le rabbinat de H. desservait également Bâle et d'autres communautés de Suisse. Le rabbin Moses Nordmann, en fonction de 1834 à 1884, fut un précurseur de l'émancipation des juifs en Suisse. Dans la première moitié du XIXe s., la communauté juive de H. était la huitième de France; en 1838, plus d'un tiers de la population était israélite. Après 1870, les juifs émigrèrent suite à deux événements: l'émancipation en Suisse et la guerre franco-allemande. En 1956, la communauté fut dissoute et la synagogue sert aujourd'hui d'atelier pour des artistes.